在佐竹家轉封到秋田藩之前，藩內有幾座礦山被開發，但採礦業卻說不上是興盛。到了佐竹家轉封後，秋田的採礦業卻極為興盛，甚至在當時的常陸流傳過這樣的話：「常陸的金礦銀礦通過地底全部都跑去秋田了…」。初代藩主義宣，在他轉封之後的慶長11年(西元1606年)時發現了院內銀山；二代義隆的時期原本被當作金礦山來開發的阿仁礦山則被發現有成為銅礦山的可能性等，於是這兩大礦山便成為往後藩政的財力來源。院內銀山和阿仁礦山雖都在藩政末期時產量衰退，但是持續在開發，之後則被明治政府所接管。
院內銀山的坑內作業圖 秋田大學礦業博物館藏
院內銀山的極盛時期約是天保7年(西元1836年)開始的約十年間，甚至曾有一個月的產量有超過100貫(375kg)的好景氣一直持續著。當時的戶數4,000戶、人口有15,000人，其繁盛熱鬧的程度可以說是快要比得上久保田的城下町。這圖被制造在安政3年（西元1858年），詳細地描寫著礦山內的作業樣子。
阿仁礦山繪圖 秋田大學礦業博物館藏
在藩政以前(佐竹家接管以前)，阿仁礦山作為金礦山廣為人知，但在寬文10年(西元1670年)來自大阪的吹屋(精煉礦物的業者)，有位名為北國屋吉右衛門之人將其作為銅山來開發，這之後便由藩接手經營。阿仁銅山在當時和伊予的別子銅山(位於今日的愛媛縣東部)，並稱為日本兩大銅山；當時18世紀提供給幕府御用的銅礦總額中有約38%產自於阿仁礦山。